O rigor científico e editorial contemplou as exigências para indexação nas mais importantes bases de dados que atuam no âmbito da saúde e globalizam informações: EMBASE/Excerpta Medica, Hygiene and Communicable Discases, MEDLINE/PubMED, LILACS, Índice de Revistas Latino-Americanas em Ciências, Tropical Diseases Bulletin e Scientific Eletronic Library Online (SciELO). Trata-se de um referencial para pesquisadores e especialistas.
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A revista ARQUIVOS DE GASTROENTEROLOGIA é órgão oficial de divulgação do Instituto Brasileiro de Estudos e Pesquisas em Gastroenterologia (IBEPEGE), Colégio Brasileiro de Cirurgia Digestiva (CBCD), Sociedade Brasileira de Motilidade Digestiva (SBMD), Federação Brasileira de Gastroenterologia (FBG), Sociedade Brasileira de Hepatologia (SBH) e Sociedade Brasileira de Endoscopia Digestiva (SOBED).
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